Музей естественной истории Академии наук Сиены под названием de 'Fisiocritici возник при основании Академии (1691 г.).
Музей называется естественной историей, потому что он включает в себя находки из трех основных царств природы: животного, растительного и минерального.
Музей родился и развивался с конца семнадцатого века, главным образом, благодаря дарам учебных коллекций многих Fisiocritici и любителей естественных наук.
Целью сборников было исследовать и публично показать правду о явлениях природы.

Результаты росли с коллекциями Джузеппе Бальдассарри (1705-1785), врачом и профессором естествознания в Университете Сиены, а также суперинтендантом коллекции естествознания Академии и Президентом до самой смерти. ,
К ним были добавлены коллекции Бьяджо Барталини (1750-1822), которые сменили его в кресле и на попечении музея.
Музей принял последовательность во второй половине 18-го века, обогатившись со временем за счет пожертвований; Собирает коллекции в основном из южной Тосканы.
Около 1970 года музей был восстановлен с сохранением экспозиции девятнадцатого века; постоянно совершенствуются для повышения удобства использования в образовании.
С 1996 года она является частью системы сиенских музеев, сегодня - Фонд сиенских музеев.