Ботанический сад Orto Botanico dell'Università di Siena (2,5 га) находится в ведении Сиенского университета.
История сада восходит к 1588 году, когда в университете начали выращивать лекарственные травы. В 1756 году область изучения трав была вытеснена естественной историей, а с 1759 года под руководством Джузеппе Бальдассарри сад начал собирать необычные растения. В 1784 году великий князь тосканский Петр Леопольд начал реформу университета, и за короткое время коллекция сада выросла до более тысячи новых растений, многие из-за рубежа. Его первый опубликованный отчет (Seminum Index Siena) содержит около 900 видов, в том числе несколько сотен из-за пределов Италии. В 1856 году сад переехал на свое нынешнее место, ботанический институт был построен в 1910-1912 годах, а в 1960-х годах площадь сада была удвоена.

Сегодня сад расположен внутри сиенских городских стен, покрывающих один склон холма долины С. Агостино. Его центральная коллекция размещена в систематическом порядке в прямоугольных цветочных клумбах с кирпичными окаймлениями, наряду со старыми образцами экзотических и местных растений. На ферме выращивают фрукты, оливковые деревья и виноградные лозы из основных сортов винограда Кьянти. В саду также есть три теплицы общей площадью около 500 м², а именно тропическая теплица, тепидарий, в котором зимой обитают экзотические виды, а также сочные коллекции (120 м²), организованные по стране происхождения, и оранжерея, содержащая плотоядные растения и основные сорта цитрусовых, выращиваемые в Европе.

Виды, эндемичные для неосвоенных участков сада, включают Alyssum bertolonii, Armeria denticulata, Centaurea aplolepa subsp. Carueliana, Euphorbia nicaensis, Stachys recta ssp. serpentinii и Thymus acicularis var. Ophioliticus.